Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snd1Q78PY7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms