Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms