Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynmQ70IV5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SynmQ70IV5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms