Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms