Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RfflQ6ZQM0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms