Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf3Q6ZQA6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf3Q6ZQA6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms