Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl9Q6ZPT1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl9Q6ZPT1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms