Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn5Q6VZZ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms