Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rhox8Q6VSS7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms