Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms