Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms