Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms