Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms