Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Slx4Q6P1D7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx4Q6P1D7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms