Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Soga3Q6NZL0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Soga3Q6NZL0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
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Soga3Q6NZL0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Soga3Q6NZL0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Soga3Q6NZL0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Soga3Q6NZL0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Soga3Q6NZL0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Soga3Q6NZL0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Soga3Q6NZL0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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