Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Szrd1Q6NXN1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms