Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd2Q6NXI6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd2Q6NXI6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms