Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms