Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdcd11Q6NS46 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd11Q6NS46 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms