Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Smarca2Q6DIC0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smarca2Q6DIC0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms