Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp7Q6A4J8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp7Q6A4J8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp7Q6A4J8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp7Q6A4J8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp7Q6A4J8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp7Q6A4J8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp7Q6A4J8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp7Q6A4J8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp7Q6A4J8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp7Q6A4J8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms