Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170Q6A065 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms