Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk13Q69ZA1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk13Q69ZA1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms