Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pan3Q640Q5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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