Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha6Q62413 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha6Q62413 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha6Q62413 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha6Q62413 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha6Q62413 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha6Q62413 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha6Q62413 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha6Q62413 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms