Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms