Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn1Q61809 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn1Q61809 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms