Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrxQ61687 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrxQ61687 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrxQ61687 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms