Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msi1Q61474 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms