Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms