Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RelnQ60841 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RelnQ60841 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RelnQ60841 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RelnQ60841 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RelnQ60841 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RelnQ60841 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RelnQ60841 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RelnQ60841 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RelnQ60841 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RelnQ60841 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RelnQ60841 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RelnQ60841 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RelnQ60841 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RelnQ60841 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms