Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms