Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms