Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms