Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psme4Q5SSW2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms