Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc88aQ5SNZ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms