Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim41Q5NCC3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms