Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf3Q5HZG4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms