Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms