Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nlrc3Q5DU56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nlrc3Q5DU56 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nlrc3Q5DU56 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nlrc3Q5DU56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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