Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chsy3Q5DTK1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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