Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms