Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdv3Q4VAA2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms