Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim26Q3V460 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms