Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Esf1Q3V1V3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms