Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms