Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnah12Q3V0Q1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnah12Q3V0Q1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnah12Q3V0Q1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnah12Q3V0Q1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnah12Q3V0Q1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnah12Q3V0Q1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnah12Q3V0Q1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms