Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms