Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca4bQ3UW98 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms