Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thsd4Q3UTY6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thsd4Q3UTY6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms